Mulai tahun 2012 banyak calon wali murid TK atau kelompok bermain yang menanyakan apakah lembaga ini ada TPA nya? Dan apabila di tidak ada TPA nya maka banyak calon murid yang tidak jadi mendaftar ke lembaga kami.
Berangkat dari kebutuhan wali murid maka mulai tahun 2013 TPA Aisyiyah Kaliwates mulai beraperasi dengan siswa dari TK atau KB. Bila pagi bersekolah di TK Aisyiyah Bustanul Athfal Kaliwates atau bersekolah di Kelompok Bermain AZ- ZAHRO Aisyiyah Kaliwates sepulang sekolah pulang ke TPA.
Pada awal beroperasi TPA Aisyiyah Kaliwates menempati ruang kelompok bermain. Apabila pagi digunakan (KB) kelompok bermain, setelah murid KB pulang maka digunakan untuk TPA, adapun pengasuh dari guru TK atau KB.
Dengan adanya animo masyarakat yang sangat besar maka jumlah murid TPA semakin meningkat, dan pada tahun 2015 ijin pendirian dan operasional baru bisa didapat dan juga pada tahun tersebut Pimpinan Cabang Aisyiyah Kaliwates bisa membeli rumah dibelakang kelompok bermain. Akan tetapi rumah tersebut perlu direhab agar layak digunakan sebagai lembaga pendidikan. Setelah direhab maka rumah tersebut layak untuk ditempati. Pada awal pandemi sekitar bulan April 2019 gedung TPA Aisyiyah Kaliwates direhab lagi agar dapat menampung lebih banyak anak dan juga menambah 2 kamar mandi. Pada bulan Oktober 2021 gedung TPA yang baru bisa dipergunakan lagi.